Bakteri İdentifikasyonu, Genel anlamı ile baktığımızda bakteri, toprakta, suda ve tüm canlı varlıklarda bulunan, mayalanma ve hastalık oluşumunda rol oynayan, tek hücreli olup, klorofilsiz ve bölünerek çoğalma özelliğinde olan tek hücreli canlıya verilen isimdir. İdentifikasyon ise bakterinin tanımı, bakteri türlerinin ve cinsinin belirlenmesine yönelik yapılan çalışmalara verilen isimdir.

Enfeksiyon hastalıklarının birçoğunda tedavi sürecinin ilk adımlarından biri, patojen mikroorganizmanın kimliğinin tespit edilmesi olmaktadır. Bu kimliğin tespit edilmesine ise İdentifikasyon denilmektedir. Kimliğin tespit edilmesi işlemleri bakterinin ait olduğu genusun ve özellikli türlerin belirlenmesine kadar sürmektedir.

Birden fazla biyokimyasal testin birlikte çalıştığı sistemlere manüel İdentifikasyon sistemleri adı verilmektedir. Bilgisayar teknolojisinde yarı ve tam otomatize bakteri tanımlama sistemleri kullanılmaktadır. Otomatize identifikasyonlar ise diğerlerine göre daha hızlıdır, tekrarlanabilir İdentifikasyon yapma özelliğe sahiptir ve teknik iş gücünü de daha az gerektirmektedir. Bunun yanı sıra, otomatize identifikasyonlar diğerlerine göre daha pahalıya mal olmaktadırlar. Ayrıca, bakteri morfolojisini önceden bilmek gerekmektedir ve biyokimyasal yönden birbirine benzeyen türlerin identifiye edilerek birbirinden ayrılması da otomatize identifikasyonlarda daha zor olmaktadır.

Genel olarak sıklıkla kullanılan biyokimyasal testler şunlardır;