Bakteri üremesi, bütün bakterilerin esas üreme şekli bölünerek üremedir. Bölünerek üreme eşeysiz üreme şeklidir su besin maddesi ve sıcaklığın uygun olduğu koşullarda çok hızlı bölünürler, bu bölünme her yirmi dakika da bir gerçekleşir böylece artmaya başlarlar fakat bu artış sürekli değildir. Çünkü zamanla ortam sıcaklığı artar ve karbondioksit birikir besin maddeleri tükenir.
Bunlar bakteriler için öldürücü doza ulaşınca artış bozulur ve azalma başlar böylece bakteri popülasyonları dengelenmiş olur bakterilerin üreme çeşitlerinden biri de sporlanmadır. Bakteri türleri yaşadıkları ortam şartları bozulunca endospor oluşturarak kötü şartları geçirirler. Endospor kalıtım materyalin çok az bir sitoplazma ile sert bir çeperle çevrilmiş halidir ortam şartları normale dönünce çeper çatlar endospor gerçekleşir ve bakteri meydana gelir. Metabolik faaliyetler minimum seviyededir bu şekilde uzun yıllar yaşayabilirler soğuk ve sıcağa karşı dayanıklıdırlar
Bakteri üremesi, eşeyli üreme de bir bakteri üreme şeklidir eşeyli üreme sayesinde kalıtsal çeşitlilik artar ve değişen ortamlara uyum sağlama artar. Eşeyli üreme esnasında DNA yapısı farklı olan bakteriler yan yana gelerek aralarında geçici bir köprü oluşturur bu köprü aracılığı ile parçalarını değiştirirler sonra ayrılarak bölünmeye devam ederler. Çok hücreli canlılara göre çok daha farklı bir üreme şeklidir bunlarda gamet oluşumu ve döllenme yoktur bakteriler diğer canlılara göre çok daha kısa zamanda mutasyona uğrarlar.
Bakterilerde görülen bu mutasyonlar genellikle zararlı ve öldürücü olmakla beraber bazen olumlu sonuçlarda verebilir.
