Bakterilerin sınıflandırılması biyoloji alanında oldukça önemli bir durumdur. Sınıflandırılmış olan bakteriler türlerine, şekillerine ve yapılarına göre farklı şekillerde gruplandırılmıştır. Bu sayede sınıflandırılmış olan bakterilerin incelenmesi ve öğretilmesi gibi durumlar çok daha kolay bir şekilde yapılabilmektedir.
Şekillerine Göre Bakteriler
Küre şeklindeki bakteriler: bu bakterilerin adı biyolojide \"coccus\" olarak belirlenmiş ve bu alanda direk bu ismi ile hitap edilmektedir. Coccus bakteri türü hem tek başına hem de toplu bir şekilde bulundukları ortamda yaşayan bakterilerdir. Şekillerinin küre olması bu bakterilerin bakteri sınıflarında ayrı bir sınıf oluşturmasında yeterli olmaktadır.
Çubuk şekilli bakteriler: bu bakterilerin adı ise biyoloji biliminde \"bacillus\" olarak bilinmektedir. Bakteri sınıfında sınıfını çubuk şeklinde olmasından alan bu bakteriler son derece zor bir şekilde ortadan kaldırılan ve oldukça inatçı bir türdür. Öyle ki verem hastalığı ya da tifo hastalığı gibi son derece tehlikeli durumların nedeni bu bakterilerdir.
Spiral şekilli bakteriler: Spirillum adı ile biyolojide yer alan bu bakteri yine şekillerine göre sıınıflandırılmış bir bakteri türüdür. Son derece kıvrımlı bir yapısı vardır ve uçlarında iki adet kamçısı bulunur. Çok aşırı tehlike yaratmaz fakat çok fazla çoğaldığında farklı problemleri ortaya çıkarabilir.
Virgül şekilli bakteriler: Adı \"vibrio\" olan bu bakterilerin şekli tahmin edildiği gibi virgül şeklindedir. Günümüzde görülen hastalıklar arasında korea hastalığında çok büyük rol oynamaktadır.
Beslenme Şekillerine Göre Bakteriler
Ototrof Bakteriler: Ototrof bakteriler kendi arasında fotosentez yapanlar ve kemosentez yapanlar olarak iki farklı gurupta incelenmektedir. Bu bakteriler inorganik maddeler içerisinden organik madde sentezleyen bir özellik gösterebilmektedir. Tabi ki bu bakteriler besinleri sentezlerken iki farklı şekilde sentezlerler.
Hetotrof Bakteriler: Hetotrof bakteriler kendi arasında üç ayrı grupta incelenmektedir;
Satrofit (Çürükçül) bakteriler: Ölü organizmaların ayrıştırılmasında çok önemli rol oynayan bu bakteriler bitki ve organik atıkları besin olarak kullanarak ayrışarak toprağa karışmasını sağlarlar. Ekolojik denge açısından çok büyük görevleri olan bu bakteriler günümüzde yararlı bakteriler olarak bilinmektedir.
Parazit Bakteriler: bu bakterilerin sindirim enzimleri bulunmamaktadır. Bu nedenle tek başına yaşamaları pek mümkün değildir. Sindirim enzimleri bulunmayan bu bakteriler farklı organizmalar ile yaşamaktadır.
Mutualist Bakteriller: bu bakteriler günümüzde birçok önemli hastalığın meydana gelmesine neden olan hastalıkların üzerinde bulunmaktadır. Bu bakterilerde farklı organizmalar olmadan yaşayamadığı için genellikle diğer organizmalar ille birlikte yaşarlar. İnsanlarda ise kalın bağırsak içerisinde son derece çok görülür.
Solunum Şekillerine Göre Bakteriler
Bu bakteriler solunum şekillerine bakarak farklı şekillerde sınıflandırılmıştır. Üç farklı şekilde sınıflandırılmış olan bu bakteriler sırası ile şu şekilde incelenebilir.
Aerop Bakteriler: Sadece oksijen bulunan ortamlarda yaşarlar ve oksijensiz çok kısa bir sürede yaşamını yitirirler. Bu bakterilerde mezozom bulunur. Aynı zamanda verem hastalığının oluşumunda büyük etkileri vardır.
Anaerop Bakteriler: bu bakteriler ise Oksijen bulunmayan ortamlarda yaşayan be oksijen temasında yaşamını sürdüremeyen bakterilerdir.
Fakültalif Anaerop Bakteriler: bu gruptaki bakteriler hem oksijenli ortamda hem de oksijensiz ortamda çok rahat bile şekilde yaşayabilirler. Bu özellikleri ile oldukça fazla görülebilmektedir.
Gram Boyası ile Boyanıp Boyanmamalarına Göre Bakteriler
Gram Pozitif: bu bakteriler zarar görmeden gram boyası ile boyanabildikleri için bakterilerin sınıflandırılması yapılırken ayrı bir grupta incelenmektedir. Bu bakteriler boyandığında mor bir renk alırlar.
Gram Negatif: bu bakteriler ise kesinlikle gram boyası ile boyanamazlar. Aksi durumlarda onlar için yaşam imkânsız bir hal alır.